W przypadku zaistnienia sytuacji wymagającej złożenie skargi, w zależności od tego kogo dotyczy skarga i co jest jej przedmiotem, wskazany jest następujący tryb postępowania:

1. Gdy skarga dotyczy niewłaściwego zachowania personelu, kwestii organizacyjnych, opieki lekarskiej i pielęgniarskiej w placówce medycznej (poradnia, szpital) pierwszym krokiem , który należy podjąć jest zgłoszenie sprawy w miejscu zdarzenia do bezpośredniego przełożonego danego pracownika. Jest to ordynator oddziału, kierownik przychodni, dyrektor ds. lecznictwa szpitala.

2. Jeśli dana placówka medyczna udziela świadczeń opieki zdrowotnej ze środków publicznych (w ramach NFZ), Świadczeniobiorcy mogą również złożyć skargę do właściwego terytorialnie oddziału wojewódzkiego Narodowego Funduszu Zdrowia.

 3. Kolejną instancją jest Centrala Narodowego Funduszu Zdrowia (02 -390 Warszawa, ul. Grójecka 186).

Od dnia 2 lipca 2010r., w związku z koniecznością dostosowania zadań Narodowego Funduszu Zdrowia do zapisów ustawy z dnia 6-listopada 2008r. o prawach pacjenta i Rzeczniku Praw Pacjenta (Dziennik Ustaw Nr 52/2009r. poz. 417), skargi i wnioski wpływające do Centrali i oddziałów wojewódzkich Narodowego Funduszu Zdrowia rozpatruje komórka ds. skarg i wniosków.

Zasady rozpatrywanie skarg i wniosków w Centrali i oddziałach wojewódzkich Narodowego Funduszu Zdrowia określa Zarządzenie Nr 31 /2010/DSS z dnia 1 lipca 2010r. Prezesa Narodowego Funduszu Zdrowia w sprawie rozpatrywania skarg i wniosków.

Pacjent, którego prawo do ochrony zdrowia nie jest realizowane w sposób dla niego zadawalający, może tez złożyć skargę do innych instytucji:
• Biura Rzecznika Praw Pacjenta
• Rzecznika Odpowiedzialności Zawodowej we właściwej terytorialnie okręgowej izbie lekarskiej
• Rzecznika Odpowiedzialności Zawodowej we właściwej terytorialnie okręgowej izbie pielęgniarek i położnych
• Biura Generalnego Inspektora Ochrony Danych Osobowych.